Antes de conhecer Michele Singer, Reiner foi casado por 10 anos com a atriz e diretora Penny Marshall, de quem adotou a filha, Tracy Reiner. Ele e Michele se conheceram durante as gravações de "Harry e Sally". Estavam casados desde 1989. Juntos, tiveram três filhos: os meninos Jake e Nick, e a menina Romy.